Investigarea resistomului, mobilomului ṣi virulomului la tulpini multirezistente nosocomiale ṣi acvatice de Acinetobacter baumannii în România
Director proiect: Conf. univ. Dr. Irina Gheorghe-Barbu
Codul proiectului: PN-III-P1-1.1-TE-2021-1515
Nr. contractului: TE 112
Titlul proiectului: Investigarea resistomului, mobilomului ṣi virulomului la tulpini multirezistente nosocomiale ṣi acvatice de Acinetobacter baumannii în România
Acronim: TITANIA
Durata: 24 luni
Valoarea totală a Contractului: 450.000,00
Data începerii contractului: 13/05/2022
Data încheierii contractului: 12/05/2024
Abstract
Apele uzate reprezintă medii de îmbogățire pentru bacterii și hotspot-uri pentru transferul orizontal de gene, prin intermediul elementelor genetice mobile (EGM) care poartă și diseminează genele de rezistență la antibiotice (GRA). Proiectul îṣi propune sǎ investigheze diseminarea genelor codificatoare de carbapenemaze, β-lactamaze de spectru extins și a markerilor de virulență la tulpini multirezistente (MDR) de Acinetobacter baumannii (AB) izolate timp de 4 ani consecutiv, în aceeași secvență temporală din infecții intra-spitalicești, reṭeaua de apǎ uzatǎ și de suprafaṭǎ din diferite regiuni geografice ale României și sǎ evidenṭieze rolul plasmidelor în rǎspândirea markerilor genetici de rezistenṭǎ ṣi de virulenṭǎ între sectorul clinic ṣi diferite compartimente ale mediului acvatic, inclusiv la peṣti. Profilurile de rezistență ale tulpinilor izolate vor fi investigate conform recomandǎrilor standardului CLSI. GRA, EGM și genele de virulență vor fi investigate prin PCR și secvențiere. Metode moleculare (PFGE / ERIC-PCR și MLST) vor fi utilizate pentru determinarea relaṭiilor de clonalitate iar transferul pe orizontală va fi demonstrat prin conjugare. Relațiile între markerii de rezistență și cei de virulență la tulpinile MDR AB vor fi evidențiate prin tehnici de secvenṭiere de generaṭie a II-a și a III-a iar plasmidele purtătoare de GRA și virulenṭǎ prin metagenomicǎ.
Obiectivul proiectului
Analiza resistomului, virulomului și mobilomului tulpinilor MDR AB producătoare de beta-lactamaze de spectru extins (ESBL) și carbapenemaze (CP) izolate din mediul spitalicesc, ape uzate spitalicești, ape uzate și de suprafață din diferite zone geografice din România și elaborarea unei metode de studiu a GRA și markerilor de virulență cu localizare plasmidială la tulpinile AB.
Rezultate estimate
Proiectul de față va oferi prima hartă a distribuției plasmidelor purtătoare de GRA și markeri de virulență (VM) la tulpinile MDR CP ESBL AB clinice versus cele izolate din mediu, precum printre primele date metagenomice ale resistomului, mobilomului și virulomului din mediu. Abordarea genomică și metagenomică poate permite identificarea unor noi determinanți genetici ai rezistenței la antibiotice, markeri de virulență și elemente genetice mobile și va permite stabilirea în premieră națională a unei metodologii de monitorizare a prezenței și dinamicii GRA și VM în mediile acvatice.
Rezumatul etapei I poate fi accesat AICI.
Rezumatul etapei a II-a, precum și diseminarea rezultatelor pot fi consultate AICI.
Rezumatul etapei a III-a, precum și diseminarea rezultatelor pot fi consultate AICI.
