“Exploring New Chemical Space for Antibiotics with Active Learning and Bacterial Phenotypic Profiling”, cu dr. Yves Brun, profesor la Université de Montréal (Canada)

Luni, 9 februarie 2026, Facultatea de Biologie a Universității din București vă invită la conferința Exploring New Chemical Space for Antibiotics with Active Learning and Bacterial Phenotypic Profiling, susținută de dr. Yves Brun, profesor la Département de microbiologie, infectiologie et immunologie, Université de Montréal (Canada).

Evenimentul va avea loc la ora 13:00, în Sala de Conferințe a Platformei de Cercetare în Biologie și Ecologie Sistemică, Facultatea de Biologie, Universitatea din București (Splaiul Independenței 91-95, București).

Despre conferință

Rezistența la antibiotice reprezintă una dintre cele mai grave amenințări la adresa sănătății globale. Cu toate acestea, progresul în dezvoltarea de antibiotice cu mecanisme de acțiune noi a fost extrem de limitat în ultimele două decenii. Metodele de Machine Learning (ML) pot accelera descoperirea de noi antibiotice prin optimizarea structurilor chimice deja cunoscute; totuși, acestea întâmpină limitări semnificative în explorarea de noi regiuni chimice, unde ar putea exista mecanisme de acțiune alternative. Conferința prezintă utilitatea metodelor bazate pe ML de învățare activă (active learning) — atât predictive, cât și generative — în vederea identificării de noi antibiotice. Îmbunătățirea performanței și antrenării modelelor ML s-a realizat prin integrarea tehnicii „bacterial cell painting”, bazată pe utilizarea de coloranți fluorescenți, în vederea obținerii de profiluri fenotipice detaliate ale răspunsului celulelor bacteriene la diverși compuși, într-un format compatibil cu testarea sistematică, la scară largă (high-throughput screening). Prin corelarea acestor profiluri de microscopie cu date provenite de la antibiotice cunoscute, și cu seturi de date CRISPRi de la nivelul întregului genom, modelele de ML pot identifica mecanismele de acțiune ale compușilor chimici testați. Astfel, integrarea metodelor bazate pe ML de învățare activă cu high-throughput screening permite identificarea și validarea de noi clase de antibiotice.

Despre profesorul invitat

Dr. Yves Brun și-a obținut doctoratul la Université Laval (1990) și a efectuat cercetări postdoctorale alături de Lucy Shapiro la Universitatea Stanford, pe tema diferențierii celulare la bacterii. După 26 de ani la Indiana University-Bloomington, unde a deținut titlul de Distinguished Professor, s-a mutat la Université de Montréal în 2019, în calitate de titular al Catedrei de Cercetare Canada 150 în biologie celulară bacteriană. Este membru (Fellow) al Academiei Americane de Microbiologie, al Asociației Americane pentru Progresul Științei, al Academiei Canadiene de Științe ale Sănătății și al Societății Regale din Canada. A primit un premiu Fulbright Scholar și premiul Murray pentru realizări în carieră din partea Societății Canadiene a Microbiologilor. A adus contribuții importante la înțelegerea proceselor bacteriene cheie, cum ar fi organizarea celulară 3D, sinteza și morfologia peretelui celular, aderența la suprafață și formarea biofilmelor, precum și biofizica aderenței bacteriene. În prezent, este directorul consorțiului PandemicStop-AI (pandemicstopai.com), dedicat accelerării descoperirii de noi antibiotice. Mai multe informații despre Profesorul Yves Brun sunt disponibile aici.