Prof. univ. dr. Ana-Nicoleta Bondar, cadru didactic la Facultatea de Fizică a Universității din București a publicat de curând un articol despre dezvoltările recente ale algoritmilor Bridge și C-Graphs, bazați pe teoria grafurilor, pentru analiza rețelelor de hidrogen din proteine.
Intitulat “Graphs of Hydrogen-Bond Networks to Dissect Protein Conformational Dynamics”, articolul a fost publicat în prestigioasa revistă The Journal of Physical Chemistry B, A Journal of The American Chemical Society.
Publicația prezintă cele mai recente dezvoltări ale algoritmilor Bridge și C-Graphs, bazați pe teoria grafurilor, pentru analiza rețelelor de hidrogen din proteine.
Așa cum se arată în articol, algoritmii facilitează analiza proteinelor complexe, cum ar fi receptorii cuplați la proteina G, GPCRs, și a proteinei spike S a virusului SARS-Covid2. GPCRs, care sunt ținte pentru medicamente, folosesc rețele interne de legături de hidrogen pentru a iniția căi de semnalizare celulară, iar algoritmii bazați pe teoria grafurilor sunt folosiți pentru a identifica locurile din proteină unde este nevoie de molecule de apă pentru a forma rețele continue de legături de hidrogen. Ca urmare, dat fiind că mutațiile în proteina A a variantei Omicron a SARS-Covid-2 afectează rețele locale de legături de hidrogen, mutațiile au potențialul să modifice dinamica conformațională a proteinei.
Articolul integral este disponibil online și poate fi accesat aici.
Rezultatele prezentate în cadrul articolului au fost obținute cu sprijinul Centrului de Cercetare Colaborativă SFB 1078 al Fundației Germane de Cercetare și prin alocări din partea HLRN, Norddeutschen Verbund zur Förderung des Hoch- und Höchstleistungsrechnens.
Ana-Nicoleta Bondar este profesor în cadrul Departamentului de Electricitate, Fizica Solidului și Biofizică al Facultății de Fizică a UB. Mai multe detalii privind profilul academic, ariile de interes și publicațiile prof. Bondar sunt disponibile aici și aici.
SECŢIUNE ACCESIBILIZATĂ PENTRU PERSOANELE CU DIZABILITĂŢI DE VEDERE
Postări asemănătoare:
Cercetători ai Centrului de Analiză Integrată și Management Teritorial din cadrul UB, coautori ai unui articol publicat în „Remote Sensing”
Cercetători ai Centrului de Analiză Integrată și Management Teritorial din cadrul UB, coautori ai unui articol publicat în „Journal of Flood Risk Management”
Cercetători ai Centrului de Analiză Integrată și Management Teritorial din cadrul UB, coautori ai unui articol publicat în „Journal of Hydrology”
Doi profesori ai Universității din București, coautori ai unui articol despre cel mai mare lac descoperit vreodată, publicat în Scientific Reports
